下記の産経新聞の記事では、その理由として、日米同盟へ悪影響を及ぼすと主張したという。これに対し、米国は「政治的影響を議論している悠長な場合ではない。自国民保護は最重要だ。」と一蹴している。
実際に日本が反対した理由は、”半径２０キロ圏内の退避、２０～３０キロの屋内退避指示”という政府の判断が正しいのか、国民に疑われることを恐れたのだろう。結果的に、米国の判断が正しかった。
残念ながら、日本政府には自国民保護は最重要という認識はなさそうだ。
産経新聞 １０月２日
原発事故避難勧告めぐる日米の舞台裏判明 官邸、米の「退避勧告」に難色
【ワシントン＝佐々木類】東日本大震災で米政府が、放射能漏れ事故を起こした東京電力福島第１原子力発電所から半径５０マイル（約８０キロ）にいる米国民に退避勧告を出す際、日本政府が日米同盟への悪影響を理由に勧告を出さないよう要請していたことが分かった。複数の日米関係筋が明らかにした。退避勧告をめぐる日米交渉の具体的な舞台裏が判明したのは初めて。米軍による“トモダチ作戦”が遂行される一方、日米双方がぎりぎりのやりとりを行っていたことが浮き彫りになった。
日米関係筋によると、米政府は原発が水素爆発や火災を起こしていた３月１６日、米国民の保護が急務との判断から、在ワシントン日本大使館の藤崎一郎大使を国務省に呼び、キャンベル国務次官補が福島第１原発から半径５０マイルにいる米国民に退避勧告を出す方針を伝えた。
この際、日本側は、「放射能汚染に関する確たる情報がなく、米政府の事前通告を聞き入れるしかなかった」（関係筋）という。
だが、別の関係者によると、藤崎大使の打電内容を伝え聞いた首相官邸側が在京米大使館側に接触、「米政府が退避勧告を出せば米国への不信感が増大して同盟関係に悪影響が出る」などとして、退避勧告の見送りを要請したという。
これに対し、米側は「政治的影響を議論している悠長な場合ではない。自国民保護は最重要だ。日本国民の理解を得られると確信している」と伝えたという。
米政府は１６日午後（日本時間１７日未明）、福島第１原発の半径５０マイルにいる米国民に退避勧告を出すとともに、日本に滞在中の米政府職員と家族に日本国外への自主的な退避を呼びかける勧告を出した。
日本政府は表向き「自国民保護の観点だろう」（当時の枝野幸男官房長官）と理解を示していたが、日本政府として半径２０キロ圏内の退避、２０～３０キロの屋内退避指示を出しており、米政府の退避勧告が同盟関係に悪影響を与えることを強く懸念していたという。
米政府は退避勧告を出す直前、原子力規制委員会（ＮＲＣ）など関係省庁の担当者６０人による電話会議を行い、「東京在住の米国民９万人全員の避難」も検討したが、このときは逆に「東京からの退避勧告は時期尚早。（刺激が強く）日米関係が揺らぐ」として、見送った経緯がある。
産経新聞
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